Program PŁATNIKA posiada dwa poziomy zabezpieczeń:

• hasło do programu podawane przez użytkownika podczas logowania się do programu. Asystent Płatnika umożliwia zmianę tego hasła na jedno z 4 słów. Użytkownik po zalogowaniu się może ponownie zmienić hasło na inne słowo. Standardowo program wymusza zmianę hasła po upływie 30 dni. AP pozwala zmienić to standardowe ustawienie na inną wartość, maksymalnie do 999 dni. Nowa wersja (od 19.06.2005r) pozwala przypomnieć zapomniane hasło administratora.
  

• hasło do bazy danych. Jest ono podawane podczas instalacji programu. Użytkownicy z reguły nie pamiętają tego hasła myląc go z hasłem administratora. Przy próbie przeniesienia programu PŁATNIKA na inny komputer należy podać to hasło. Program AS tworząc archiwum tworzy odpowiedni plik z zaszyfrowanym hasłem i umożliwia bezbolesną zmianę lokalizacji programu lub odtworzenie bazy z archiwum. Nowa wersja (od 19.06.2005r) pozwala przypomnieć zapomniane hasło do bazy danych.